员工信誉保证金制度不合法。

在我国，根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条明确规定，用人单位招用劳动者时，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，避免用人单位将经营风险不合理地转嫁给劳动者。

如果用人单位违反这一规定，以信誉保证金的名义向员工收取财物，那么根据《劳动合同法》第八十四条，劳动行政部门会责令用人单位限期退还给劳动者本人，并以每人五百元以上二千元以下的标准处以罚款；如果给劳动者造成损害的，用人单位还应当承担赔偿责任。

因此，员工信誉保证金制度是不合法的，用人单位应当严格遵守法律规定，不得向劳动者收取任何形式的保证金或押金。如果劳动者遇到公司要求缴纳信誉保证金的情况，有权拒绝，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。