关于股东与公司之间的借款如何审查认定，这是一个涉及公司法、财务和税务等多个方面的问题。以下是对此问题的详细解答：

一、审查借款的程序合规性

1. 借款程序：首先，要审查借款是否经过了合法的程序。公司资金属于法人财产，非经法定程序不得随意挪用。大股东从公司借款，应当经过董事会或股东会的决议，明确借款的金额、用途、还款期限、利息等条款，并确保这些决策都如实记录在公司的财务账簿中。

2. 合同或协议：借款行为应当有明确的合同或协议作为依据，其中应详细列明借款的条款和条件，包括借款金额、借款日期、还款日期、利息计算及支付方式等。

二、审查借款的入账情况

1. 如实入账：借款必须如实反映在公司的财务账簿中，包括借款的流入和后续的还款情况。这有助于确保公司财务的透明度和准确性。

2. 会计记录：公司应保留完整的会计记录，以追踪借款的使用情况和还款进度。这些记录对于后续的税务处理和法律审查都至关重要。

三、审查借款的税务影响

1. 税务处理：如果借款长期未还且无正当理由，税务部门可能会将其视为股东分红，从而要求缴纳个人所得税。因此，在审查借款时，需要考虑其潜在的税务影响。

2. 合规性检查：公司应定期进行税务合规性检查，确保借款的税务处理符合相关法律法规的要求。

四、审查借款对公司及其他股东的影响

1. 公司利益：借款行为不应损害公司的整体利益。如果借款导致公司资金紧张或影响公司的正常运营，那么这种借款行为可能需要重新审视。

2. 其他股东权益：大股东从公司借款时，应确保不会损害其他股东的权益。如果借款行为未经其他股东同意或损害了他们的利益，其他股东有权要求返还借款并赔偿损失。

五、法律追责与风险防范

1. 法律追责：如果大股东借款未还且违反了相关法律法规或公司章程的规定，公司可以通过法律途径追讨借款并要求支付逾期利息。在极端情况下，如果大股东的行为构成犯罪（如挪用资金罪），还可能面临刑事处罚。

2. 风险防范：为了防范此类风险，公司应建立健全的内部控制制度，明确借款的审批流程和入账要求。同时，公司还应定期对借款进行审查和监控，确保借款的合规性和安全性。

综上所述，股东与公司之间的借款审查认定是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑程序合规性、入账情况、税务影响、公司及其他股东的利益以及法律追责与风险防范等多个方面。通过全面的审查和评估，可以确保借款行为的合法性和合规性，维护公司的整体利益和股东的权益。