农村自建房安全隐患排查的主要依据是《全国自建房安全专项整治工作方案》以及相关法律法规。具体分析如下：

一. 排查依据

1. 《全国自建房安全专项整治工作方案》：该方案要求各地要对本行政区域内城乡所有自建房进行排查摸底，全面摸清自建房结构安全性、经营安全性、房屋建设合法合规性等基本情况。这一要求为农村自建房安全隐患排查提供了直接的政策依据。

2. 相关法律法规：虽然直接针对农村自建房安全隐患排查的法律法规可能并不特定，但《建筑法》、《安全生产法》等法律法规中，对于建筑安全、施工安全以及责任主体等方面都有明确规定，这些规定同样适用于农村自建房的安全隐患排查。

二. 排查内容与实施

• 排查内容主要包括自建房的结构安全性、经营安全性以及房屋建设的合法合规性等方面。
• 排查工作应由地方政府组织，按照“谁拥有谁负责、谁使用谁负责、谁主管谁负责、谁审批谁负责”的原则进行。
• 对存在安全隐患的自建房，应实施分类整治，确保整改到位。

三. 长效机制与责任落实

• 工作方案还强调要逐步建立城乡房屋安全管理长效机制，包括加强日常检查、加快建立房屋安全隐患常态化巡查发现机制等。
• 同时，要落实用地、规划、建设、经营等审批部门的安全监管责任，加强房屋安全管理队伍建设，充实基层监管力量。

我建议：在进行农村自建房安全隐患排查时，应严格按照《全国自建房安全专项整治工作方案》的要求进行，并结合相关法律法规，确保排查工作的全面、细致和有效。同时，也要注重建立长效机制，落实各方责任，确保农村自建房的安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。