违法所得扣除税款的法律依据主要涉及到《行政处罚法》以及相关的税务法律法规。以下是具体的解释：

1. 根据《行政处罚法》的相关规定：在计算违法所得时，通常会考虑扣除当事人已经依法缴纳的税款。这是因为违法所得是指当事人通过违法手段获得的收入，而税款是当事人依法应当缴纳给国家的部分，不属于当事人的违法所得。因此，在计算违法所得并决定处罚金额时，应当扣除已经缴纳的税款部分。
2. 根据税务法律法规：在具体的税务处理中，对于违法所得涉及的税款，也有相应的规定。例如，如果当事人通过违法手段获得的收入需要缴纳税款，那么在计算违法所得时，应当扣除已经缴纳的税款部分，以避免重复计算或处罚。

综上所述，违法所得扣除税款的法律依据主要来自于《行政处罚法》以及相关的税务法律法规。在实际操作中，需要根据具体情况来确定是否可以扣除税款以及扣除的具体金额。如果你在这方面有具体的法律问题或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的解答。