针对您提出的“非法捕捞案件修复方案”问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

一、非法捕捞案件的背景与法律依据

非法捕捞行为严重破坏了水生生物资源和渔业水域生态文明，为此，农业农村部办公厅印发了《非法捕捞案件涉案物品认（鉴）定和水生生物资源损害评估及修复办法（试行）》（以下简称《办法》），旨在依法惩治非法捕捞行为，规范损害评估与修复工作。

二、修复方案的制定原则

1. 依法依规：根据《中华人民共和国渔业法》、《中华人民共和国环境保护法》等相关法律法规，以及《办法》的具体规定，制定修复方案。

2. 谁损害、谁修复：遵循生态损害责任原则，由非法捕捞当事人承担水生生物资源修复义务。

3. 科学性与可操作性：修复措施应充分考虑科学性和可操作性，确保修复效果。

三、修复方案的具体内容

1. 损害评估：

   • 直接损害评估：评估非法捕捞渔获物的价值，包括国家重点保护水生野生动物、地方重点保护水生野生动物以及其他渔获物的价值。对于电鱼、毒鱼、炸鱼等严重非法捕捞行为，还需综合评估已致死但未被捕获的水生生物的价值。
   • 间接损害评估：评估非法捕捞行为对水生生物生长发育、繁殖终止和栖息地破坏等方面的损害量。对于使用电、毒、炸等严重破坏资源环境的方式或禁用渔具从事非法捕捞的，应加重间接损害的评估。

2. 修复措施：

   • 增殖放流：根据捕捞水域的水生生物资源状况、水环境条件、涉案渔获物组成等因素，综合确定增殖放流的种类和数量。选择适宜的苗种进行放流，以恢复水生生物种群。
   • 栖息地修复：采取设置人工鱼巢、人工鱼礁等措施，修复受损的水生生物栖息地，改善其生存环境。

3. 修复费用与责任：

   • 非法捕捞当事人应承担修复费用，包括增殖放流和栖息地修复所需的全部费用。费用安排一般不低于所造成的水生生物资源损害总量。
   • 当事人不具备修复能力的，可以委托具备相应修复能力的第三方实施修复工作。

4. 监督与管理：

   • 渔业行政处罚机关应加强对当事人履行修复义务的监督管理，确保修复措施得到有效实施。
   • 履行修复义务情况可以作为案件处罚的参考依据。

四、实际案例参考

以东海海域的非法捕捞案为例，被告人蔡某某和张某某因使用禁用渔具非法捕捞水产品被判处有期徒刑，并需共同承担生态修复费用和鉴定费用。该案例展示了非法捕捞行为的法律后果以及生态修复责任的实际承担情况。

综上所述，非法捕捞案件的修复方案应依据相关法律法规和规定制定，遵循“谁损害、谁修复”的原则，采取科学、可行的修复措施，并由渔业行政处罚机关进行监督管理。通过实施修复方案，可以有效恢复水生生物资源和渔业水域生态文明。