针对您提出的“同一法人两家公司，公司与公司之间借款怎么处理”的问题，以下是我的详细解答：

首先，需要明确的是，即使两家公司由同一法人控制，它们在法律上仍然是两个独立的实体，各自拥有独立的财产和债务。因此，两家公司之间的借款处理应遵循一般的商业借款原则，并受到相关法律法规的约束。

一、借款协议

1. 签订书面协议：两家公司之间发生借款时，应签订书面的借款协议，明确借款金额、借款期限、利率（如有）、还款方式等关键条款。
2. 协议内容合法：借款协议的内容应符合相关法律法规的规定，不得存在违法或损害第三方利益的情况。

二、资金流转

1. 资金划转：借款协议签订后，出借公司应按照协议约定的方式和时间将借款资金划转给借款公司。资金划转应保留相应的银行转账记录或凭证，作为后续对账或纠纷解决的依据。
2. 账务处理：两家公司应分别在各自的财务账簿中记录这笔借款和还款的交易，确保账务清晰、准确。

三、税务处理

1. 利息收入与支出：如果借款协议中约定了利息，那么出借公司应将其视为利息收入，借款公司则应将其视为利息支出。两者都需要按照税法规定进行税务申报和缴纳。
2. 避免税收风险：两家公司在处理借款税务时，应遵守税法规定，避免税收风险。如有需要，可以咨询专业的税务顾问或会计师。

四、风险防控

1. 避免滥用法人独立地位：同一法人控制的两家公司应严格区分各自的财产和债务，避免滥用公司法人独立地位和股东有限责任来逃避债务或损害债权人利益。
2. 关注关联方交易：如果两家公司被认定为关联企业，那么它们之间的借款交易可能会受到更严格的监管和审查。因此，在处理关联方交易时，应更加谨慎和合规。

五、纠纷解决

1. 协商解决：如果两家公司在借款处理过程中发生纠纷，应首先通过友好协商解决。协商不成的，可以寻求法律途径解决。
2. 法律途径：如协商无果，出借公司或借款公司可以向法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自身合法权益。

综上所述，同一法人两家公司之间的借款处理应遵循相关法律法规和商业原则，确保交易的合法性、合规性和安全性。如有任何疑问或需要进一步帮助，请咨询专业的法律顾问或会计师。