县扶贫入股项目带动贫困户分红，期满村收回本金的处理方式，主要依据双方的协议约定及相关法律规定进行。具体分析如下：

一. 协议约定优先

1. 查看协议条款：首先，应详细查阅县扶贫入股项目与贫困户或村集体之间签订的协议，特别是关于本金回收、分红方式及期限、违约责任等关键条款。
2. 按约执行：若协议中明确规定了本金在分红期满后的回收方式，则应严格按照协议约定执行。例如，协议可能规定本金需一次性返还，或分期逐步返还。

二. 法律规定补充

1. 若无明确约定：若协议中未对本金回收作出明确规定，或规定不明确，则可参考相关法律法规进行补充解释。例如，《中华人民共和国合同法》中关于合同履行、解释及争议解决的规定。
2. 公平原则：在法律框架内，应遵循公平原则处理本金回收问题。若项目运营良好，贫困户已获得合理分红，且项目方有能力返还本金，则应按公平原则协商确定本金回收方式。

三. 实际操作建议

1. 双方协商：基于协议约定及法律规定，建议县扶贫部门与贫困户或村集体进行友好协商，共同确定本金回收的具体方式及时间。
2. 考虑项目持续性：在协商过程中，应充分考虑项目的持续性及未来合作的可能性，确保本金回收不会对项目运营造成过大压力。
3. 书面确认：协商达成一致后，应形成书面文件，如补充协议或备忘录，明确本金回收的具体安排，以确保双方权益得到保障。

综上所述，处理县扶贫入股项目带动贫困户分红期满后的本金回收问题，应首先依据双方协议约定进行，若协议无明确规定，则参考相关法律规定，并遵循公平原则进行协商处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。