针对“公司司机不服从指挥，员工怎么应对”的问题，首先我们要明确，这是一个关于职场行为规范和劳动纪律的问题，同时也可能涉及到劳动法的相关规定。以下是我作为专业律师给出的建议：

1. 明确指挥的合理性：

   • 员工应先判断司机的不服从行为是否基于合理的理由。如果指挥本身存在不合理、不合法或超出职责范围的情况，员工可以提出异议，并寻求上级或相关部门的协调。

2. 沟通解决：

   • 在确认指挥合理的前提下，员工可以尝试与司机进行沟通，了解其不服从的原因，并寻求双方都能接受的解决方案。有效的沟通往往能够化解误会，避免冲突升级。

3. 报告上级：

   • 如果沟通无果，员工应及时将情况报告给上级或人力资源部门。上级或人力资源部门可以介入调查，并根据公司规定和劳动法相关规定，对司机进行相应的处理。

4. 遵循公司规定和劳动法：

   • 员工在处理此类问题时，应严格遵守公司的规章制度和劳动法的相关规定。不得采取过激行为或侵犯司机合法权益的行为。

5. 寻求法律援助：

   • 如果司机的行为严重违反了公司规定或劳动法，且对公司或员工造成了损失，员工可以寻求法律援助，通过法律途径维护公司的合法权益。

综上所述，面对公司司机不服从指挥的情况，员工应首先判断指挥的合理性，尝试通过沟通解决问题。如果沟通无果，应及时报告上级或人力资源部门，并严格遵循公司规定和劳动法相关规定处理。在必要时，可以寻求法律援助来维护公司的合法权益。