针对您提出的“非法建设用地如何办理正规手续”的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

首先，需要明确的是，非法建设用地必须依法先进行查处，包括罚款、整改、追责等程序。这是根据自然资源部（原国土资源部）的明确规定，旨在遏制违法用地行为，确保土地管理秩序。

一、查处程序

1. 立案调查：

   • 自然资源主管部门会对违法地块进行立案，明确违法主体、面积、用途以及违法性质。

2. 行政处罚：

   • 下发《行政处罚决定书》，其中可能包括责令退还土地、限期拆除或没收违法建筑、罚款等。罚款标准通常按照《土地管理法》的规定，非法占用土地每平方米罚款100-1000元，具体数额根据违法情节和土地类型而定。

3. 责任追究：

   • 对单位负责人或直接责任人，可能会移交纪检监察机关或司法机关进行处理。

4. 执行处罚与整改：

   • 违法者需要拆除不符合国土空间规划的违法建筑，恢复土地原状；或者对符合规划的违法建筑进行没收，由地方政府处置。
   • 足额缴纳罚款及滞纳金，逾期未缴将申请法院强制执行。
   • 整改完成后，由自然资源部门现场验收，确认土地恢复或没收处置到位，并在相关系统中销号，解除违法状态。

二、补办建设用地审批手续

在完成上述查处程序并整改到位后，方可申请补办建设用地审批手续。具体条件包括：

1. 地块已纳入国土空间规划：

   • 确保地块已纳入国土空间规划确定的建设用地范围。

2. 落实耕地占补平衡：

   • 如果涉及耕地占用，需要落实耕地占补平衡政策。

3. 缴纳土地出让金及相关税费：

   • 根据规定缴纳土地出让金及相关税费。

4. 无其他违法违规行为：

   • 确保没有其他违法违规行为，如与生态保护红线冲突等。

三、特殊情况处理

1. 符合规划但未批先用的项目：

   • 如果项目符合规划且属于民生、基础设施等公益性质，可能可以没收建筑物后补办手续；如果是商业开发，则需从严审核，可能要求重新招拍挂。

2. 历史遗留违法用地：

   • 对因政策调整或历史原因形成的违法用地，可按“分类处置”政策处理，但仍需履行处罚程序。

四、未履行处罚的后果

1. 补办手续无效：

   • 未完成查处的补办审批可能被上级部门撤销或认定为无效。

2. 法律风险：

   • 用地单位可能面临二次处罚，甚至被追究非法占用土地罪的刑事责任。

3. 信用惩戒：

   • 违法主体将被列入“土地市场失信名单”，影响后续拿地、融资等。

五、操作建议

1. 主动配合查处：

   • 发现违法后立即整改，避免被列入重大典型案件公开通报。

2. 精准规划匹配：

   • 确保违法地块符合国土空间规划，否则只能拆除。

3. 准备完整材料：

   • 补办时需提交行政处罚决定书、罚款缴纳凭证、整改验收证明、用地预审文件等完整材料。

综上所述，非法建设用地要办理正规手续，必须先经过依法查处程序，整改到位后，再按照相关规定申请补办建设用地审批手续。在整个过程中，建议咨询当地自然资源部门或专业律师，以确保流程的合法性和顺利性。