关于“法院申请仲裁协议无效费用交过后后续”的问题，以下是我的详细解答：
结论前置：
仲裁协议无效后，已缴纳的仲裁费用退还情况需依具体情形而定。若仲裁程序未启动或已启动但未裁决，通常应退还已缴仲裁费；若仲裁程序已进行到一定阶段，如已进行部分证据交换、开庭审理等，则会根据已发生的费用支出酌情扣除部分后再退。具体退费标准和程序由仲裁机构的仲裁规则规定，当事人应与仲裁机构沟通协商，按规定办理退费手续。
详细解答：
仲裁协议无效且仲裁程序未启动或未裁决：
- 在这种情况下，由于仲裁协议无效，仲裁机构通常没有权力或义务继续进行仲裁程序。
- 因此，已缴纳的仲裁费用通常应全额退还给当事人。
- 当事人应与仲裁机构沟通协商，确保退费事宜得到妥善处理。
仲裁协议无效但仲裁程序已进行到一定阶段：
- 如果仲裁程序已经启动，并且进行到了一定的阶段，如已经进行了部分证据交换、开庭审理等，那么仲裁机构可能会根据已经发生的费用支出，酌情扣除部分费用后再将剩余费用退还给当事人。
- 这种情况下，退费的具体金额和程序会由仲裁机构的仲裁规则来规定。
- 当事人应与仲裁机构详细沟通，了解退费的具体情况和流程，并按规定办理退费手续。
退费争议解决：
- 如果在退费过程中发生争议，当事人可以通过法律途径来解决。
- 例如，可以向仲裁机构所在地的法院提起诉讼，要求仲裁机构按照相关规定退还费用。
- 在诉讼过程中，当事人应提供充分的证据来证明自己的主张，并依法维护自己的合法权益。
法律建议：
- 在申请仲裁前，应仔细审查仲裁协议的效力，确保仲裁协议的有效性和合法性。
- 如果发现仲裁协议无效，应及时与仲裁机构沟通协商，了解退费的具体情况和流程。
- 如果在退费过程中遇到任何问题或争议，应及时寻求法律帮助，依法维护自己的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。