在商业开发用地征收过程中，乡镇政府、村委会和农民共同签订征收协议的做法，实际上涉及了我国土地管理制度和征收程序的特定安排。以下是对这一做法的详细解释：

1. 土地所有权与使用权：

   • 在我国，土地所有权主要归国家所有（全民所有）或集体所有。对于农村集体土地，其所有权归村集体，而农民则享有土地承包经营权或宅基地使用权。
   • 当商业开发需要征收农村集体土地时，由于土地所有权归村集体，因此征收协议需要由村集体（通常通过村委会代表）来签订。

2. 乡镇政府的角色：

   • 乡镇政府作为基层行政机关，在土地征收过程中承担着重要的协调和管理职责。
   • 乡镇政府会参与征收协议的签订过程，以确保征收工作的合法性和规范性，同时协调解决征收过程中可能出现的各种问题。

3. 农民的参与：

   • 农民作为土地的实际使用者或承包者，其权益在征收过程中必须得到充分保障。
   • 因此，征收协议需要由农民本人签订，以确认其同意征收并了解相关补偿安置方案。

4. 协议签订的意义：

   • 乡镇政府、村委会和农民共同签订征收协议，既体现了对土地所有权的尊重，也体现了对农民权益的保护。
   • 通过签订协议，可以明确征收的范围、补偿标准、安置方式等关键条款，为后续的征收工作提供法律依据。

综上所述，商业开发用地征收协议由乡镇政府、村委会和农民共同签订，是符合我国土地管理制度和征收程序的。这种做法既确保了征收工作的合法性和规范性，也充分保障了农民的合法权益。如果你在这一过程中遇到任何问题或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。