当您遇到对方不配合公司股份处理的情况时，可以采取以下步骤来解决问题：
一、查阅公司章程与相关法律法规
首先，建议详细查阅公司章程，了解其中关于股权转让、变更的具体规定以及程序要求。公司章程是公司内部管理的基本法规，对于股东的行为具有约束力。同时，您也需要熟悉《公司法》等相关法律法规，以便在后续操作中做到有法可依。
二、与其他股东沟通协商
在确认公司章程与法律法规后，尝试与不配合的股东进行沟通，了解其不配合的具体原因，并尝试通过协商达成一致意见。在沟通过程中，可以明确表达您的立场和诉求，同时听取对方的意见，寻求双方都能接受的解决方案。
三、依法召开股东会并作出决议
如果沟通协商无果，您可以依据公司章程和《公司法》的规定，依法召开股东会。在股东会上，按照法定或章程规定的表决程序，对股权变更等事项进行表决。若其他股东过半数同意股权变更且放弃优先购买权，即便部分股东不配合，也可依法进行变更登记。
四、采取法律手段维护权益
书面通知与催告：在股东会决议后，可以向不配合的股东发出书面通知，要求其配合完成股权变更手续，并明确告知其不配合可能产生的法律后果。
提起诉讼：若书面通知与催告仍然无效，您可以向法院提起诉讼，要求确认股权转让协议有效，并强制不配合的股东配合办理股权变更登记等相关事宜。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持您的诉求，如股权转让协议、股东会决议、通知其他股东的相关证据等。
追究赔偿责任：若不配合的股东的行为给公司或其他股东造成了损失，您还可以依法追究其赔偿责任。这包括因股权变更延迟而影响公司经营发展所产生的直接经济损失等。
五、综合考虑多种解决方案
在处理过程中，建议您综合考虑多种解决方案，包括但不限于协商、调解、仲裁和诉讼等。选择最适合您情况的解决方案，以最高效、最经济的方式解决问题。
总之，当遇到对方不配合公司股份处理的情况时，您需要保持冷静、理性应对。通过查阅公司章程与相关法律法规、与其他股东沟通协商、依法召开股东会并作出决议以及采取法律手段维护权益等步骤，您可以有效地解决问题并保护自己的合法权益。