房屋买卖合同无效但已经转移登记了，该房屋应当归还给原所有权人。以下是对此结论的详细解释：

法律依据与解释

根据《民法典》第一百五十七条的规定，当合同被判定为无效时，行为人通过这一合同而获取的任何财产都必须原物奉还；若无法实现返还或者返还并无实际意义，则需以货币形式进行折价补偿。这一原则同样适用于房屋买卖合同无效但已经过户的情况。

具体处理流程

1. 确认合同无效：首先，需要明确房屋买卖合同无效的原因，这可能包括合同内容违法、合同主体不具备相应资格、合同意思表示不真实等。一旦合同被确认为无效，其自始不发生法律效力。

2. 物权返还：基于无效合同取得的房屋物权缺乏合法基础，因此应当予以返还。买受人应当将房屋归还给原所有权人，即出卖人。

3. 登记更正：在房屋已经过户的情况下，原所有权人可以向不动产登记机构申请更正登记，将房屋权属恢复到自己名下。如果登记机关的登记行为存在错误或违法情形，原物权人也有权申请登记机关进行更正。

4. 损失赔偿：如果因房屋转移给原所有权人造成了损失，过错方应当承担相应的赔偿责任。这包括因合同无效导致的直接损失以及因房屋过户产生的相关费用等。

注意事项

• 及时行动：一旦确认合同无效，买受人应当尽快与原所有权人协商归还房屋，并办理相关登记更正手续。
• 保留证据：在处理过程中，买受人应当保留好相关证据，如合同文本、过户记录、沟通记录等，以备不时之需。
• 咨询专业意见：如果遇到复杂情况或争议，买受人可以寻求专业律师的帮助，以获取更具体的法律建议和支持。

综上所述，房屋买卖合同无效但已经转移登记的情况下，买受人应当将房屋归还给原所有权人，并办理相关登记更正手续。同时，过错方应当承担相应的赔偿责任。