工程款支票一般不能直接入别人的账户。下面我将从法律和专业角度对此进行详细解释：
支票的法律性质：支票是委付证券，是出票人签发的，委托办理支票存款业务的银行或者其他金融机构在见票时无条件支付确定的金额给收款人或者持票人的票据。因此，支票上的收款人应当是特定的，且通常与出票人存在合同关系或债权债务关系。
工程款的支付规定：在工程合同中，工程款的支付通常遵循严格的合同约定和财务流程。支票作为支付工具，其上的收款人应当与合同约定的收款方一致，以确保资金流的合法性和合规性。
入账的合规性：将工程款支票入别人的账户，可能涉及违反合同约定的支付条款，甚至可能构成不当得利或挪用资金等法律风险。此外，银行在办理支票入账时，也会核对支票上的收款人信息，以确保资金支付的准确性。
特殊情况的处理：当然，也存在一些特殊情况，如经过合同双方协商一致，并通过合法手续变更收款人，或者存在债权转让等法律行为，使得支票上的收款人可以合法变更为第三方。但这种情况下，必须确保所有相关手续齐全、合法，并符合相关法律法规的规定。
综上所述，工程款支票一般不能直接入别人的账户。如果确实需要变更收款人，建议咨询专业律师或相关机构，以确保操作的合法性和合规性。如有其他法律问题，欢迎随时向我提问。