未办理大件超限运输证进行运输，将可能面临责令停止违法行为、罚款、扣留车辆等处罚，具体处罚措施根据超限程度及具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：

一. 责令停止违法行为

• 公路管理机构或县级以上道路运输管理机构有权责令当事人立即停止超限运输的违法行为，这是为了保障公路的安全和道路运输的合法性。

二. 罚款

• 根据超限程度的不同，罚款金额也有所差异：
  1. 车货总高度、宽度、长度未超过一定标准的，可能面临200元以下的罚款；
  2. 超过一定标准但未特别严重的，罚款金额在200元以上1000元以下；
  3. 超限情况较为严重的，罚款金额在1000元以上3000元以下；
  4. 若车货总质量超标，还将根据超重量进行额外罚款，最高不超过30000元。
• 若存在违法所得，相关部门将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；若无违法所得或违法所得不足2万元，将处以3万元以上10万元以下的罚款。

三. 扣留车辆

• 公安机关交通管理部门有权依法扣留涉案车辆，直至车主或驾驶员提供有效的超限运输许可证或消除超限状态。

四. 其他可能的处罚

• 根据具体情况，还可能面临警告、吊销驾驶证等其他行政处罚措施。
• 如果未办理大件超限运输证的行为构成犯罪，如造成严重后果或屡教不改，还可能依法追究刑事责任。

我建议车主或驾驶员在从事大件超限运输前，务必了解并遵守相关法律法规，确保合法合规地进行道路运输。如已面临处罚，应积极配合相关部门的调查和处理，及时采取措施消除超限状态，并依法承担相应的法律责任。如有进一步需要，您可以继续咨询我。