当已向法院申请了清算而合伙负责人拒绝鉴定机构清算时，你可以采取以下措施来应对：

1. 查看合伙协议：

   • 首先，应仔细查阅合伙协议中关于清算的相关条款，明确合伙人的权利义务以及清算的条件、程序等。
   • 如果合伙协议中明确规定了清算的程序和合伙人的配合义务，那么拒绝清算的合伙人将违反协议约定，你可以据此追究其责任。

2. 尝试协商解决：

   • 与拒绝清算的合伙人进行沟通协商，阐明清算对各方的重要性和必要性。
   • 尝试说服其同意进行清算，并共同委托专业机构或人员进行清算。

3. 向法院申请指定清算人：

   • 如果协商无果，你可以向法院提起诉讼，请求法院指定清算人进行清算。
   • 法院会根据具体情况，依据相关法律规定指定合适的清算主体，以确保清算工作的顺利进行。

4. 自行清算（如符合法律规定）：

   • 在某些情况下，如果符合法律规定，其他合伙人也可自行组织清算。
   • 但自行清算需严格按照法律程序进行，确保清算过程合法、公正、透明，以维护各方利益。

5. 保存证据：

   • 在整个过程中，务必注意保存好合伙期间的各类财务账目、合同协议、业务往来记录等相关证据。
   • 这些证据对于准确核算合伙财产、明确各方权益以及后续可能出现的法律纠纷都至关重要。

综上所述，面对合伙负责人拒绝鉴定机构清算的情况，你应首先查看合伙协议中的相关条款，并尝试通过协商解决。如果协商无果，可以向法院提起诉讼并申请指定清算人进行清算。同时，务必保存好相关证据以维护自身权益。如果你在这个过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。