开立保函的手续费通常由申请人支付，但也可以由受益人在特定情况下支付。具体情况如下：

1. 一般情况：在大多数商业实践中，开立保函的费用，包括手续费，通常由申请人（即要求银行出具保函的一方）承担。这是因为申请人通常是保函的发起者，也是保函所保障交易或合同的主要受益者。

2. 特殊情况：然而，在某些特定情况下，受益人也可能会同意支付手续费或其他相关费用。这通常发生在受益人希望通过支付这些费用来获得某些额外的好处或保障，或者当申请人与受益人之间有特殊的商业安排时。例如，如果受益人急于促成交易，且申请人提出由受益人承担部分或全部费用的要求，受益人可能会同意这一安排。

3. 合同条款：最终是否由受益人支付手续费，应明确写在保函的条款中。这是为了确保双方对费用的承担有明确的了解和同意，避免后续产生纠纷。因此，在签订保函之前，双方应仔细协商并明确费用承担问题。

总之，虽然开立保函的手续费通常由申请人支付，但在特定情况下，受益人也可能会同意支付这些费用。具体安排应根据双方的协商和保函的条款来确定。如果你在这方面有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，请随时向我咨询。