如果工程结算后发现结算单有错误，并主张按正确金额支付欠款，法院在核实相关证据后，一般会支持按正确金额进行支付。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国合同法》（虽已废止，但相关原则在新颁布的《民法典》中得以延续）的相关规定，当事人应当遵循诚实信用原则，按照约定全面履行自己的义务。如果结算单存在错误，且该错误并非由于故意或重大过失造成，那么主张按正确金额支付欠款是符合合同精神和法律规定的。
   • 《民法典》第五百七十七条也规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。因此，如果结算单错误导致未完全履行合同义务，主张纠正并支付正确金额是合理的。

2. 证据要求：

   • 为了得到法院的支持，主张方需要提供充分的证据来证明结算单存在错误。这些证据可能包括原始的合同文件、施工记录、工程量清单、签证单等，以及能够证明结算单错误的具体计算依据和说明。
   • 法院在审理过程中，会对这些证据进行审查，并可能要求双方进行质证。如果证据充分且能够证明结算单确实存在错误，那么法院一般会支持按正确金额进行支付。

3. 实际情况考虑：

   • 在实际操作中，如果结算单错误是由于双方的计算方法、理解差异或沟通不畅导致的，那么通过协商和调解解决可能更为高效和便捷。
   • 如果协商不成，主张方可以通过诉讼途径来维护自己的权益。在诉讼过程中，除了提供充分的证据外，还需要注意诉讼时效、管辖法院等法律问题。

综上所述，如果工程结算后发现结算单有错误，并主张按正确金额支付欠款，法院在核实相关证据后一般会予以支持。但主张方需要提供充分的证据来证明结算单存在错误，并注意相关的法律程序和规定。如果你在这方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。