购买农村拆迁房时签订的协议，在大多数情况下是有效的，但这也取决于多个因素。以下是对这一问题的详细解答：

一、协议有效的条件

1. 双方真实意愿：

   • 协议必须是买卖双方的真实意思表示，不存在欺诈、胁迫或其他导致合同无效的情形。
   • 双方应具有相应的民事行为能力，即能够理解和承担协议所带来的法律后果。

2. 合法合规：

   • 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。
   • 协议不得违背公序良俗，即社会公共秩序和善良风俗。

3. 无产权纠纷：

   • 房屋应无产权纠纷，否则会给协议的履行带来风险。

二、可能影响协议效力的因素

1. 交易限制：

   • 如果拆迁房在一定期限内限制交易转让，这可能影响协议的履行，但不一定导致协议无效。
   • 买方在签订协议前应详细了解房屋的交易限制情况，并在协议中明确相关条款。

2. 产权状况：

   • 拆迁房未取得房产证就进行交易存在风险，如卖方拿到房产证后可能不配合过户或进行一房二卖。
   • 买方应确保房屋产权清晰，无争议，并在协议中明确产权转移的相关条款。

三、协议无效的情形

1. 违反法律强制性规定：

   • 如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该协议将被认定为无效。

2. 存在欺诈、胁迫等情形：

   • 如果协议是在欺诈、胁迫等不正当手段下签订的，那么当事人有权请求撤销该协议。

四、建议与注意事项

1. 详细了解房屋情况：

   • 在签订协议前，买方应详细了解房屋的产权状况、交易限制、是否存在纠纷等情况。

2. 明确协议条款：

   • 协议中应明确双方的权利义务、违约责任、产权转移、交易限制等相关条款，以确保协议的履行和双方权益的保障。

3. 咨询专业人士：

   • 在签订协议前，建议咨询专业的律师或房产中介，以获取更专业的法律意见和建议。

综上所述，购买农村拆迁房时签订的协议在大多数情况下是有效的，但买方应确保协议满足有效条件，并详细了解房屋情况和交易限制。在签订协议前，建议咨询专业人士以确保自身权益得到保障。