病历扣罚直接扣罚科主任是不合理的。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 病历扣罚的责任归属

1. 直接责任人：病历扣罚通常是由于病历书写、管理或质量控制方面存在问题而引发的。根据“谁犯错，谁负责”的原则，直接责任人应当是具体参与病历书写、审核或管理的医务人员，而非科主任。
2. 科主任的责任：科主任作为科室的管理者，对科室的病历质量负有监管责任。但这种责任更多是管理上的，而非直接参与病历的书写或审核。因此，科主任不应成为病历扣罚的直接对象。

二. 病历扣罚的法律依据

1. 《医疗质量管理办法》：该办法规定了医疗机构应当加强医疗质量管理，建立医疗质量控制体系，并对医疗质量进行持续改进。但并未明确规定病历扣罚应直接扣罚科主任。
2. 《病历书写基本规范》：此规范对病历的书写提出了具体要求，但同样未提及病历扣罚应直接针对科主任进行。

三. 病历扣罚的合理实施方式

1. 明确责任：医疗机构应明确病历书写的责任主体，确保每个医务人员都清楚自己的职责和义务。
2. 合理扣罚：对于病历书写、管理或质量控制方面存在的问题，应根据问题的性质和严重程度，对直接责任人进行相应的扣罚。
3. 加强监管：科主任作为管理者，应加强对科室病历质量的监管，确保病历的书写、审核和管理符合相关规定。但科主任的监管责任不应成为其被直接扣罚的理由。

综上所述，病历扣罚直接扣罚科主任是不合理的。医疗机构应明确责任主体，合理实施扣罚，并加强监管，以确保病历的书写、审核和管理符合相关规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。