水生野生动物的认定由农业农村部会同国务院有关部门进行。

一. 认定机制：

• 根据农业农村部发布的关于进一步加强珍贵濒危水生野生动物保护管理工作的通知，水生野生动物的认定是保护管理工作的重要环节。
• 通知中明确指出，农业农村部会同国务院有关部门确定并发布水生野生动物重要栖息地，并采取相应的保护措施。

二. 具体执行：

• 各级渔业渔政主管部门在辖区内依法做好水生野生动物及其栖息地的调查、监测和评估工作，并建立相关档案。
• 对于被认定为重要栖息地的区域，将采取划定禁渔区、规定禁渔期等措施予以严格保护。

三. 法律依据：

• 虽然直接关于水生野生动物认定的具体法律条款未在此通知中明确列出，但通知作为农业农村部发布的规范性文件，具有指导和规范水生野生动物保护管理工作的效力。
• 在实际操作中，水生野生动物的认定应参照农业农村部及国务院相关部门的发布和规定执行。

我建议：对于具体的水生野生动物认定问题，应关注农业农村部及国务院相关部门的最新发布和规定，以确保获取最准确的信息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。