在刑事附带民事案件中，当民事部分的被告是公司时，法院判决中应当写“被告”而非“被告人”。以下是详细解释：

1. 法律术语的区别：

   • “被告人”通常指的是刑事诉讼中被指控犯罪并接受审判的个人或单位，它更多地与刑事责任相关联。
   • “被告”则是民事诉讼中的术语，指的是被原告提起诉讼并要求承担民事责任的一方，无论是个体还是公司。

2. 刑事附带民事诉讼的性质：

   • 刑事附带民事诉讼是在刑事诉讼过程中，由被害人或相关权利人提起的，要求犯罪人或其他责任主体承担民事赔偿责任的诉讼。
   • 在这种诉讼中，既包含对犯罪人的刑事追责，也包含对民事责任主体的民事赔偿请求。

3. 公司作为民事被告的合理性：

   • 当公司作为民事赔偿的责任主体时，其在诉讼中的地位是“被告”，而非“被告人”。
   • 这是因为公司作为法人，其承担的是民事责任，而非刑事责任。即使在刑事附带民事诉讼中，公司也是因其在民事法律关系中的行为或义务而承担责任。

4. 法院判决的表述：

   • 在法院判决中，为了准确区分刑事和民事责任主体，通常会明确写明“被告人”（指刑事责任主体）和“被告”（指民事责任主体）。
   • 因此，当民事部分的被告是公司时，法院判决中应当写“被告公司”，以体现其作为民事责任主体的身份。

综上所述，刑事附带民事案件中民事部分的被告是公司时，法院判决应当写“被告”而非“被告人”。这是基于法律术语的准确运用、刑事附带民事诉讼的性质以及公司作为民事责任主体的合理性所得出的结论。