青苗补偿协议的主体通常涉及以下两方面：
一、主要主体
征收方或政府部门：在大多数情况下，青苗补偿协议是由征收方或相关的政府部门与被征收人签订的。这是因为征收方或政府部门是负责实施征收行为以及补偿工作的主体，它们有权力也有责任与被征收人就青苗补偿事宜达成协议。
被征收人：被征收人，即青苗的所有者或使用者，是青苗补偿协议的另一方主体。他们有权根据协议获得相应的补偿，并需要履行协议中规定的义务。
二、特殊情况下的主体
在特定条件下，建设方也可能成为青苗补偿协议的主体之一，但这需要满足以下条件：
建设方参与征地：如果建设方不仅负责建设施工，还参与到了征地的过程当中，那么它有可能与被征收人签订青苗补偿协议。
合法授权：建设方必须获得合法的授权，才能与被征收人签订青苗补偿协议。这种授权通常来自于征收方或政府部门，确保建设方的行为是基于合法的征地程序和授权进行的。
然而，与建设方签订青苗补偿协议存在一定的法律风险，包括主体资格风险、补偿标准风险、履行风险以及变更与解除风险等。因此，在签订协议时，必须特别谨慎地审查其合法性和合规性，确保被征收人的合法权益得到保障。
综上所述，青苗补偿协议的主体主要是征收方或政府部门与被征收人。在特殊情况下，建设方也可能成为协议的主体，但必须基于合法的征地程序和授权，并谨慎审查其合法性和合规性。