同程旅行扣违约金主要依据双方签订的合同条款以及《中华人民共和国民法典》的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一. 合同约定的违约金条款
合同自由原则：根据《民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。这意味着，如果同程旅行在合同中明确规定了取消订单或定错酒店等违约行为需要支付违约金，并且消费者在预订时同意了该条款，那么同程旅行在发生违约行为时扣除违约金是有合同依据的。
违约金的合理性：虽然合同中可以约定违约金，但违约金的数额应当合理。如果违约金数额过高，超出了实际损失的合理范围，消费者有权请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。因此，同程旅行在设定违约金数额时，需要确保其合理性。
二. 实际违约情况
违约行为的认定：同程旅行扣除违约金的前提是消费者确实存在违约行为，如取消订单、定错酒店等。如果消费者并未违约，或者违约行为并非由消费者自身原因造成（如不可抗力因素），那么同程旅行无权扣除违约金。
违约责任的承担：在消费者确实存在违约行为的情况下，同程旅行有权依据合同约定要求消费者承担违约责任，包括支付违约金。但同程旅行在行使这一权利时，应当遵循公平、诚实信用的原则，不得滥用权利损害消费者的合法权益。
三. 消费者权益的保护
知情权与选择权：根据《消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买、使用商品或者接受服务过程中享有知情权和选择权。同程旅行在提供服务时，应当充分保障消费者的知情权和选择权，不得通过格式条款等方式排除或限制消费者的权利。
争议解决：如果消费者对同程旅行扣除违约金的行为存在争议，可以通过协商、调解、投诉、仲裁或诉讼等方式解决。在争议解决过程中，消费者应当保留好相关证据，如合同文本、交易记录、沟通记录等，以便维护自己的合法权益。
我的观点：同程旅行扣除违约金的行为主要依据双方签订的合同条款以及《民法典》的相关规定。但同程旅行在行使这一权利时，应当确保违约金的合理性，并充分保障消费者的知情权和选择权。如果消费者对扣除违约金的行为存在争议，可以通过合法途径维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。