在对方主责、己方次责的情况下，修理对方车辆的流程通常如下：

首先，双方需要通知各自的保险公司进行定损评估。保险公司会对受损车辆进行详细的检查，并确定修理所需的费用。

接下来，修理费用会从双方的机动车交通事故责任强制保险（交强险）的责任限额中先行赔付。一般来说，交强险的财产损失赔偿限额为2000元。

如果修理费用超过了交强险的责任限额，那么超出的部分将按照责任比例进行分摊。在这种情况下，主要责任方（对方）将承担大部分的修理费用，而次要责任方（己方）则只需支付较少的费用。具体来说，如果总修理费是10000元，交强险先赔付2000元，那么剩下的8000元中，对方作为主责方可能需要承担70%，即5600元；而己方作为次责方则需要承担30%，即2400元。

当然，如果双方都有有效的商业保险，那么超出交强险范围的部分还可以由各自的商业保险来承担。对方车辆的损失，在己方交强险赔偿后，剩余部分由对方的商业险（如果有）或者对方个人承担；同样，己方车辆的损失，在对方交强险和商业险（如果有）赔偿后，剩余部分由己方的商业险或者己方个人承担。

总的来说，修理对方车辆的流程就是先定损、再赔付、最后按责任比例分摊剩余费用。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。