关于您提出的“一个法人的两家公司是否需要分别做两个三同时”的问题，首先我们需要明确“三同时”的具体含义。在环境保护法中，“三同时”制度是指建设项目中环境保护设施必须与主体工程同时设计、同时施工、同时投产使用的制度。这是为了确保建设项目在投产后，其污染物的排放能够符合国家或地方规定的排放标准，从而保护环境，防止污染。

接下来，我们根据您的问题进行具体分析：

1. 如果两家公司分别属于不同的建设项目：

   • 在这种情况下，每家公司的建设项目都需要独立进行环境影响评价，并按照“三同时”制度的要求，分别设计、施工和投产使用环境保护设施。因此，两家公司需要分别做两个“三同时”。

2. 如果两家公司虽然由同一法人控制，但运营独立，且各自有独立的建设项目：

   • 即便这两家公司由同一法人控制，但由于它们各自有独立的建设项目，因此同样需要按照“三同时”制度的要求，分别进行环境保护设施的设计、施工和投产使用。所以，这种情况下也需要分别做两个“三同时”。

3. 如果两家公司实际上是在同一个建设项目下运营：

   • 如果这两家公司实际上是在同一个建设项目下运营，且该建设项目已经按照“三同时”制度的要求进行了环境保护设施的设计、施工和投产使用，那么这两家公司就不需要分别做两个“三同时”。它们可以共享同一个环境保护设施，并共同遵守相关的环境保护规定。

综上所述，一个法人的两家公司是否需要分别做两个“三同时”，取决于这两家公司的具体情况。如果它们分别属于不同的建设项目或各自有独立的建设项目，那么就需要分别做两个“三同时”；如果它们实际上是在同一个建设项目下运营，那么就不需要分别做两个“三同时”。希望这个解答能够帮到您，如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时联系我。