当您与网约车发生碰撞且被认定为全责时，对于网约车的停运损失费，您需要按照一定流程进行处理。

首先，明确一点，网约车作为经营性活动车辆，因事故无法经营产生的合理停运损失，您作为侵权人是有赔偿责任的。为了确定具体的赔偿金额，您可以要求网约车司机提供运营流水、维修时间证明等材料，以便双方能够自行协商赔偿数额。

在协商过程中，如果双方能够达成一致，那么您可以按照协商的金额进行赔偿。然而，如果协商无果，网约车司机可能会选择通过法律途径来解决问题，即向法院提起诉讼。在这种情况下，您需要积极应对，按照法律程序处理，并尊重法院的判决结果。

此外，关于停运损失的赔偿是否有法律依据，答案是肯定的。根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》，因道路交通事故造成依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持。因此，您作为全责方，对网约车的合理停运损失进行赔偿是有法律依据的。

最后，需要注意的是，停运损失的计算通常基于网约车的每日平均营业收入，并会考虑到运营成本、盈利状况等多方面因素。如果双方在停运损失的计算或赔偿协商上存在疑问，或者对于后续可能出现的纠纷不知如何处理，建议咨询专业律师或相关机构以获取更详细的法律建议。

综上所述，处理与网约车碰撞后的停运损失费问题，需要您与网约车司机进行积极沟通、协商，并在必要时寻求法律途径解决。同时，也要了解相关法律法规和赔偿标准，以确保您的权益得到合理保障。