医院秘方专利制剂没有经营制剂经营许可证是违法的。具体分析如下：

一. 医院秘方专利制剂属于药品范畴

• 根据《中华人民共和国药品管理法》的相关规定，药品的生产、经营、使用均需遵守该法。医院秘方专利制剂，作为具有特定疗效的药品，其生产、经营同样受到法律的严格监管。

二. 经营制剂需要经营许可证

• 依据《药品管理法》第五十一条：“从事药品批发活动，应当经所在地省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门批准，取得药品经营许可证。从事药品零售活动，应当经所在地县级以上地方人民政府药品监督管理部门批准，取得药品经营许可证。无药品经营许可证的，不得经营药品。”因此，医院若要经营其秘方专利制剂，必须取得相应的经营制剂经营许可证。

三. 未取得经营许可证的法律后果

• 若医院未取得经营制剂经营许可证而擅自经营其秘方专利制剂，将面临法律的制裁。根据《药品管理法》的相关规定，未取得药品经营许可证经营药品的，由药品监督管理部门依法予以取缔，没收违法生产、销售的药品和违法所得，并处违法生产、销售的药品（包括已售出和未售出的药品）货值金额十五倍以上三十倍以下的罚款；货值金额不足十万元的，按十万元计算。

综上所述，医院秘方专利制剂没有经营制剂经营许可证是违法的，医院应当严格遵守相关法律法规，取得相应的经营许可证后方可经营其秘方专利制剂。如有进一步需要，您可以继续咨询我。