医疗罚款部门主要有三个，分别是医保局、卫健委以及市场监督管理局。

一. 医保局

• 医保局主要负责医保基金监管，检查重点是否存在违规使用医保基金的行为、医保基金管理是否规范、是否故意骗取医保基金等。只要诊所申请了医保定点或是开通了门诊统筹，就会被医保局监管。若诊所有相关违规行为，可能会受到责令退回医保基金、解除医保定点服务协议、暂停医保基金使用、吊销执业资格等行政处罚。

二. 卫健委

• 卫健委关注的是医疗服务质量和安全，包括执业资质问题、药械管理、院感防控以及信息公示等。他们会检查诊所的《营业执照》、《诊所备案凭证》、医护人员的执业资格证以及诊疗行为和登记许可范围是否符合规定。若诊所存在违规行为，可能会面临没收违法所得、暂停或吊销许可证等处罚。

三. 市场监督管理局

• 市场监督管理局对所有生意进行监管，包括诊所的经营是否合法、药品是否过期、器械是否正规等。他们的检查内容主要涉及医疗机构资质、药品器械进销存管理、药品器械质量管理、医疗广告与宣传以及收费与透明度。若诊所有违规行为，可能会受到没收违法所得和非法财物、责令停产停业等处罚。市场监督管理局是罚款最重的部门，因此诊所需要特别注意遵守相关规定。

综上所述，医疗罚款部门主要包括医保局、卫健委和市场监督管理局。为了避免被罚款，诊所需要提前了解各部门的监管内容，并严格遵守相关规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。