车位上停自家摩托车是否违法，需根据具体情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：
私人停车位：
- 若车位是私人所有的，且未经允许或明确禁止摩托车停放，摩托车停在此处可能构成侵权或违反相关管理规定，属于违法行为。因为车主进入私人停车场即与停车场管理方形成契约关系，应遵守其规定。
公共停车场或小区、商场等提供的停车位：
- 在这些场所，摩托车能否停放需查看具体的管理规定或当地相关法规。若规定中明确禁止摩托车停放于小车位，或划定了摩托车的专门停放区域，则摩托车停在小车位上属于违规行为。
- 若无明确规定，摩托车停放在空闲的小车位上一般不构成违法，但仍需考虑是否影响其他车辆和行人通行，以及是否符合公共秩序。
公共道路上的停车位：
- 在设有摩托车专用停车位的路段，摩托车停入小车位可能违反《中华人民共和国道路交通安全法》及其实施条例的相关规定，属于违法行为，交通管理部门可对其进行处罚。
- 若道路上没有专门设置摩托车停车位，也没有禁止摩托车停放小车位的标识，且摩托车停放未妨碍其他车辆和行人通行，则一般不被认定为违法。但需注意，不同地区的交警部门可能有不同的执法标准和习惯。
综上所述，摩托车停在车位上是否违法，需综合考虑停车场或停车位的性质、具体管理规定以及当地相关法规。为避免不必要的法律麻烦，建议摩托车车主在停车前仔细查看停车场或停车位的规定和标识，确保合规停车。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。