公司开公户银行收取代理费是否合法，需根据具体情况判断。

一. 银行收费需有法定依据或合同约定

1. 法律依据：根据《中华人民共和国商业银行法》及相关金融法规，银行在提供服务时，有权收取合理的费用。但这些费用必须基于法律的规定或双方的有效约定。
2. 合同约定：如果银行与公司之间签订了开户协议或其他相关合同，并且合同中明确规定了代理费的收取标准和方式，那么银行收取代理费就是合法的。

二. 判断银行收费是否合法

1. 查看合同：首先，公司应查看与银行签订的合同中是否有关于代理费的条款。如果有，且条款内容合法、明确，那么银行收取代理费就是合法的。
2. 咨询银行：如果合同中没有明确规定，或者公司对合同条款有疑问，可以向银行咨询并要求其提供收费的依据。
3. 监管投诉：如果公司认为银行收费不合理或没有法律依据，可以向银行业监管机构投诉，要求调查处理。

三. 实例说明

• 例如，某公司与银行签订开户协议时，协议中明确规定了每年需支付一定金额的账户管理费。这种情况下，银行收取该费用就是合法的，因为双方已经在合同中达成了约定。

我建议公司在面对银行收费问题时，应首先查看与银行签订的合同，了解收费的具体条款和依据。如果认为银行收费不合理或存在争议，可以及时与银行沟通协商，或向银行业监管机构寻求帮助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。