《保障中小企业款项支付条例》一般不溯及既往。下面我将从法律原则、条例特点以及实际操作等角度进行详细解释：

1. 法律原则：

   • 法律溯及力，也称法溯及既往的效力，是指法对其生效以前的事件和行为是否适用。若适用，则具有溯及力；若不适用，则不具有溯及力。
   • 一般来说，法律应当具有明确性和稳定性，不应随意变动，也不应轻易对过去的行为进行追溯。因此，除非法律有明确规定，否则新法通常不具有溯及既往的效力。

2. 条例特点：

   • 《保障中小企业款项支付条例》是为了保障中小企业的合法权益，规范款项支付行为而制定的。
   • 该条例在制定时，通常会考虑到中小企业的实际情况和市场需求，以及与之相关的法律环境和政策背景。
   • 条例的施行日期通常会明确规定，且一般自公布之日起施行，对于施行前的行为，除非条例有特别规定，否则不适用该条例。

3. 实际操作：

   • 在实际操作中，对于《保障中小企业款项支付条例》施行前的款项支付行为，如果双方已经按照当时的法律法规和合同约定履行了义务，那么一般不会因为该条例的施行而受到影响。
   • 如果在条例施行前存在款项支付纠纷，那么应当依据当时的法律法规和合同约定进行处理，而不是直接适用该条例。

综上所述，《保障中小企业款项支付条例》一般不溯及既往，除非该条例有特别规定。如果你在实际操作中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。