公司正在使用的生产设备在特定情况下是可以被查封拍卖的。以下是对此问题的详细分析：

1. 查封拍卖的前提：

   • 一般来说，当公司涉及法律纠纷，如债务未清偿、合同违约等，且经法院判决后拒不执行判决时，法院有权采取很多强制措施，包括但不限于查封公司的财产，包括正在使用的生产设备。
   • 查封后，若公司仍未能履行相关法律义务，法院可以进一步决定对这些设备进行拍卖，以所得款项来清偿债务或执行判决。

2. 查封拍卖的例外情况：

   • 在某些特殊情况下，法院可能会考虑企业的实际运营需要，采取“活封”等柔性措施。这意味着虽然设备被查封，但允许企业在一定条件下继续使用这些设备，以维持其正常的生产经营活动。这种措施通常是在法院认为直接拍卖设备可能导致企业破产或无法继续经营，从而对社会经济造成更大影响时采取的。
   • 此外，如果设备已经作为抵押物被登记，且抵押权人同意在不影响抵押权的情况下继续让企业使用，那么这些设备也可能不会被立即拍卖。

3. 法律建议：

   • 如果公司面临被查封拍卖的风险，建议尽快寻求专业法律帮助，评估自身法律状况，并探索可能的解决方案，如与债权人协商、寻求和解或重组等。
   • 同时，公司也应加强内部管理，确保合规经营，避免涉及不必要的法律纠纷。

综上所述，公司正在使用的生产设备在特定情况下是可以被查封拍卖的，但具体是否会被查封拍卖以及查封拍卖的具体条件，需要根据公司的实际法律状况和法院的裁决来确定。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。