针对您提出的“串通投标罪的违法所得怎么处理”的问题，以下是我为您提供的清晰、详细且有深度的解答：
一、串通投标违法所得的处罚方式
在串通投标罪中，对于违法所得的处理主要遵循以下原则：
没收违法所得：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，若存在违法所得，将并处没收违法所得。
罚款：
- 除了没收违法所得，违法者还需面临中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款。
- 对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，还将处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。
取消投标资格与吊销营业执照：
- 情节严重的，将取消违法者一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格，并予以公告。
- 在极端情况下，工商行政管理机关可能会吊销其营业执照。
刑事责任：
- 若构成犯罪，将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第二百二十三条，情节严重的串通投标行为可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
二、串通投标违法所得的认定
串通投标中的违法所得主要包括两类：
中标人的利润或高于市场价的利润：
- 这部分利润是通过不正当手段（如串通投标）获得的，因此被视为违法所得。
协助某投标人取得中标资格而获得酬金：
- 如果某方协助他人通过串通投标取得中标资格，并因此获得酬金，这部分酬金也被视为违法所得。
三、立案追诉标准
涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
- 损害招标人、投标人或者国家、集体、公民的合法利益，造成直接经济损失数额在五十万元以上的。
- 违法所得数额在十万元以上的。
- 中标项目金额在二百万元以上的。
- 采取威胁、欺骗或者贿赂等非法手段的。
- 虽未达到上述数额标准，但两年内因串通投标受过行政处罚二次以上，又串通投标的。
- 其他情节严重的情形。
综上所述，对于串通投标罪的违法所得，法律将采取严格的处罚措施，包括没收违法所得、罚款、取消投标资格、吊销营业执照以及追究刑事责任等。这些措施旨在维护招标投标的公平、公正和诚实信用原则，保护招标人、投标人和国家、集体、公民的合法权益。