存疑的鉴定结论不能单独作为认定事实的依据。在民事案件中，鉴定结论作为证据的一种，其证明力需要经过法庭的审查和确认。如果鉴定结论存在疑点，或者其真实性、准确性、合法性受到质疑，那么它就不能直接作为认定案件事实的依据。
具体来说，法庭在审查鉴定结论时，会考虑以下几个方面：
鉴定机构的资质和鉴定人的资格：法庭会审查鉴定机构是否具备相应的鉴定资质，以及鉴定人是否具备专业的鉴定资格。如果鉴定机构或鉴定人缺乏相应的资质或资格，那么其出具的鉴定结论的可信度就会受到质疑。
鉴定程序的合法性：法庭会审查鉴定程序是否合法，包括鉴定的申请、委托、实施、出具报告等各个环节是否符合法律规定。如果鉴定程序存在违法情形，那么其出具的鉴定结论的合法性就会受到质疑。
鉴定结论的科学性和准确性：法庭会审查鉴定结论是否科学、准确，是否符合客观事实。如果鉴定结论存在科学上的错误或者与客观事实不符，那么其证明力就会受到质疑。
因此，如果鉴定结论存在疑点，法庭会结合其他证据进行综合审查，或者要求重新进行鉴定。在民事诉讼中，任何证据都需要经过法庭的审查和确认，才能作为认定案件事实的依据。如果存疑的鉴定结论被法庭采纳，可能会导致案件事实的认定出现错误，进而影响案件的公正处理。
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