关于“土地实际被他人占用42年，其使用权怎么认定”的问题，我们可以从以下几个方面来详细分析：
核心结论
土地的使用权归属，首先以登记为准。若土地被非法占用，使用权仍归原登记人，且原登记人有权要求侵权人停止侵权、返还土地，并赔偿损失。
具体分析
使用权登记原则：
- 根据法律规定，土地使用权以登记为准。若土地已按照法律程序进行了登记，且未办理变更登记等法定手续，则土地的使用权归原登记人所有。
非法占用处理：
- 若土地被他人非法占用，原登记人有权要求侵权人停止侵权行为，排除妨碍，并可通过协商、调解或诉讼等方式维护自己的合法权益。
- 侵权人若无法律依据占用土地，原登记人可要求其返还土地，并赔偿因占用造成的损失。
特殊情况处理：
- 若占用是基于合法原因，如借用、租赁等，则应按照相关约定处理。
- 若占用期间产生了收益，如种植作物等，其归属和处理需根据具体情况和法律规定来判断。
法律途径维权：
- 若协商无果，原登记人可向当地的土地管理部门反映，请求其介入调查和调解。
- 若仍无法解决，可收集相关证据，如土地权属证明、被占土地现状照片等，向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，请求法院判令侵权方返还土地、赔偿损失等。
总结
综上所述，土地实际被他人占用42年，其使用权仍归原登记人所有。若土地被非法占用，原登记人有权采取多种法律手段维护自己的合法权益，包括要求侵权人停止侵权、返还土地，并赔偿损失。在处理过程中，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。若你有进一步的问题或需要详细的法律帮助，请直接向我咨询。