公司收到国家指明用途的专项资金一般不能被法院执行。下面我将从法律角度详细解释这一结论：

1. 专项资金的性质：

   • 专项资金是国家或有关部门下拨给行政事业单位，具有专门指定用途或特殊用途的资金。
   • 这种资金要求单独核算，专款专用，不能挪作他用。

2. 法律依据：

   • 根据《人民币银行结算账户管理办法》第十三条，设立专用账户应严格实行专项管理和支付，否则应认定为一般往来资金，并可予以冻结和扣划。
   • 《民事诉讼法》相关规定也指出，人民法院在查询、扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产时，不得超出被执行人应当履行义务的范围，且应保留被执行人及其所扶养家属的生活必需品。

3. 法院执行的原则：

   • 人民法院在采取冻结措施时，不得冻结被申请执行人银行账户内国家指明用途的专项资金。
   • 但如果被执行人用这些名义隐蔽资金逃避履行义务的，人民法院可以冻结。

4. 实际执行中的考量：

   • 法院在强制执行中，会判定企业的存款性质，以存款用途及账户的种类作为标准。
   • 对于更新改造等专项资金，法院会根据存款的特定用途来决定是否执行。

综上所述，公司收到的国家指明用途的专项资金，由于其专款专用的性质，一般不会被法院执行。但如果公司存在用这些资金隐蔽逃避履行义务的行为，法院则有可能采取冻结措施。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。