在起诉离婚的案件中，对方要求查流水是合法的，但这一行为必须遵循法定的条件和程序。以下是对此问题的详细解答：
一、合法性依据
在离婚诉讼中，如果一方怀疑对方存在转移、隐匿夫妻共同财产等行为，确实有权向法院申请查询对方的银行流水。这是为了查明财产状况，确保财产分割的公平性和合理性。法院在审查后，如果认为申请合理且与案件紧密相关，会依法向相关银行发出调查令，要求提供指定时间段的银行流水记录。
二、申请条件与流程
合理怀疑：申请人需要有合理的怀疑依据，比如发现对方有大额资金异常转出且无法说明合理用途，或者存在其他隐匿财产的嫌疑。
提交申请：当事人或其诉讼代理人需要将书面申请提交至受理案件的法院，详细说明查询银行流水的目的、必要性和相关线索（如开户银行、大致时间段等）。
法院审查：法院会对申请进行严格审查，考虑是否属于离婚案件的必要证据、是否侵犯对方合法权益等因素。如果审查通过，法院会依法发出调查令。
三、注意事项
尊重隐私权：在申请查询银行流水时，应尊重对方的隐私权，不得滥用查询权利。查询范围应限于与案件相关的时段和账户，避免无根据的广泛查询。
综合证据链：银行流水作为单一证据可能不足以充分证明当事人的主张。因此，建议结合其他证据（如聊天记录、转账凭证等）共同形成完整的证据链。
法律指导：在整个过程中，建议咨询专业律师以获取具体的法律指导和帮助，确保操作的合法性和有效性。
综上所述，起诉离婚时对方要求查流水是合法的，但必须在符合法定条件和程序的前提下进行。如果双方对财产分割存在争议，建议通过法律途径解决，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议。