如果发现身份证被人注册为公司法人且存在违规行为，您应立即采取行动来维护自己的合法权益。以下是一套详尽的处理方案：
一、立即确认情况并报警投诉
确认身份被冒用：
- 通过“国家企业信用信息公示系统”或市场监管总局的相关平台，如微信小程序“电子营业执照”，查询并确认相关公司的任职情况，并截图保存作为证据。
- 前往当地市场监督管理部门，申请查阅该公司注册时的相关档案资料，特别是注册申请文件，核实是否有您的签名或其他个人信息，以确认真实性。
报警处理：
- 立即向所在地的公安机关报案，详细说明您的身份证被他人冒用注册公司的情况。
- 如果侵权行为导致了经济损失或危害了社会公共利益，公安机关将依法进行侦查，这可能涉及刑事犯罪，如伪造国家机关公文、证件罪等。
向工商部门投诉：
- 同时，向当地工商行政管理部门（现为市场监督管理部门）提交书面申诉材料，明确阐述您的身份信息被冒用的情况。
- 要求工商部门撤销该公司的行政许可或吊销其登记，以纠正这一错误。
二、全面收集并提交证据
收集直接证据：
- 包括但不限于公司注册文件上的非本人签名（如有必要，可申请笔迹鉴定）。
- 与冒用人的聊天记录、通话录音等，以证明您对此事并不知情且未参与公司注册。
整理间接证据：
- 身份证遗失公告、报警回执、挂失补办记录等，这些都能作为您身份被冒用的辅助证据。
- 保留好所有与身份被冒用相关的查询记录、截图和文档，以便后续使用。
提交证据材料：
- 将收集到的所有证据材料整理好，并提交给公安机关和市场监督管理部门，以支持您的申诉和报案。
三、通过法律途径维护权益
消除不良影响：
- 在完成上述投诉举报程序后，及时与相关部门沟通，要求他们协助消除因身份冒用给您带来的不良信用记录，如债务纠纷、税务问题等。
考虑民事诉讼：
- 如果身份被冒用导致了经济损失（如差旅费、误工费等），或者上述方式无法解决问题，您可以考虑通过民事诉讼的方式向实际侵权人、注册代理机构以及被注册的公司主张赔偿。
- 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明损失与身份冒用行为之间的因果关系。
四、咨询专业律师并持续保留证据
寻求专业指导：
- 在整个处理过程中，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
- 律师可以提供针对性的法律策略，确保您的权益得到最大程度的保护。
持续保留证据：
- 注意保留好所有与案件相关的证据材料，包括报警记录、投诉记录、相关公司登记信息、笔迹鉴定报告等。
- 这些证据将在后续的法律程序中起到至关重要的作用，也是您维护自己权益的有力武器。
五、总结与预防
综上所述，发现身份证被人注册为公司法人且存在违规行为后，您应迅速采取行动，通过报警、投诉、法律途径和咨询专业律师等方式来维护自己的合法权益。同时，也要加强个人信息保护意识，避免身份证等重要证件被他人冒用。未来在处理个人证件和信息时，应更加谨慎小心，以防类似事件再次发生。