在两人合伙办小企业并共有房产及注册公司的情况下，分家涉及的法律问题较为复杂，需要综合考虑多个方面。以下是我为您提供的分析和建议：

1. 明确合伙协议内容：

   • 首先，应查阅合伙协议，明确双方的权利义务、出资比例、利润分配方式以及退伙、解散等条款。
   • 如果合伙协议中有关于分家或解散时的财产分割约定，应按照协议执行。

2. 房产分割：

   • 共有房产的分割需考虑出资比例、登记情况、实际使用状况等因素。
   • 双方可协商通过出售房产后分割售房款，或一方支付另一方相应对价后取得房产所有权。
   • 如协商不成，可通过法律途径解决，如起诉至法院，由法院根据具体情况判决。

3. 公司分割：

   • 公司作为法人实体，其分割需遵循公司法等相关法律法规。
   • 双方可协商通过股权转让、公司注销或分立等方式进行处理。
   • 如选择股权转让，需明确转让价格、支付方式及时间等条款，并办理相关变更登记手续。
   • 如选择公司注销或分立，需按照法定程序进行清算、分配剩余财产等。

4. 税务及债务处理：

   • 分家过程中可能涉及税务问题，如房产转让税、公司股权转让税等，应依法纳税。
   • 同时，应清理并分割合伙期间的债务，确保双方各自承担相应责任。

5. 法律程序：

   • 如双方无法协商达成一致，可通过调解、仲裁或诉讼等法律程序解决争议。
   • 在此过程中，建议聘请专业律师提供法律支持，确保合法权益得到保护。

综上所述，两人合伙办小企业分家需综合考虑合伙协议、房产分割、公司分割、税务及债务处理等多个方面。建议您与合伙人充分沟通，协商解决方案，并在必要时寻求专业律师的帮助。