已经立案的民间借贷撤诉确实需要缴纳一定费用，通常是减半收取案件受理费。下面我详细解释一下：

在民间借贷纠纷中，如果案件已经立案，但随后当事人决定撤诉，那么根据相关规定，法院一般会减半收取案件受理费。这是因为诉讼程序启动后，法院已经为案件投入了相应的司法资源，而撤诉是当事人对其诉讼权利的处分行为。减半收取费用，一方面是对当事人随意处分诉权的一种适当限制，避免滥用撤诉权利；另一方面也在一定程度上补偿了法院因案件审理所付出的成本。

案件受理费的具体金额受案件标的额等因素影响，标的额越大，费用越高。撤诉后，已缴的案件受理费会减去一半退还。例如，如果原本应缴纳的案件受理费是1000元，那么撤诉后将退还500元。

不过，需要注意的是，不同法院可能会根据具体情况规定不同的退费标准或有特殊规定。因此，在实际操作中，当事人应向法院了解清楚撤诉所需承担的费用情况，确保自身权益得到妥善处理。

总之，已经立案的民间借贷撤诉确实需要缴纳费用，具体数额需根据实际情况和法院规定来确定。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。