民事立案后能否注销营业执照，取决于立案的具体情况和性质。以下是详细分析：

1. 若立案针对企业一般经营问题，且未进入清算等限制阶段：

   • 在这种情况下，企业理论上可以按法定程序申请注销营业执照。这通常包括成立清算组、通知债权人申报债权、清理公司财产等步骤，清算结束后即可申请注销登记。

2. 若立案涉及重大违法犯罪、税务或债务纠纷：

   • 如果企业因涉及重大违法犯罪、税务纠纷或债务纠纷而被立案，且已被司法机关或行政机关限制，或在调查过程中要求企业保持现状配合调查，此时注销营业执照会受限。
   • 擅自注销在此情况下可能涉嫌妨碍司法或行政调查，企业需要承担相应的法律责任。

综上所述，民事立案后能否注销营业执照并非一概而论，而是需要根据立案的具体情况和性质来判断。如果您面临此类问题，建议详细咨询当地工商管理部门或专业律师，以确保您的操作符合法律法规的要求。作为专业律师，我擅长处理公司事务和股权转让等领域的法律问题，如有需要，您可以直接向我咨询。