违反保密协议并不一定需要支付违约金。具体分析如下：
法律规定：
- 根据《劳动合同法》第二十五条，除本法第二十二条（服务期约定）和第二十三条（竞业限制约定）规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。这意味着，在一般情况下，即使劳动者违反了保密协议，也不需要支付违约金。
违约金的适用情形：
- 劳动者违反服务期约定或竞业限制约定的，才需要按照约定向用人单位支付违约金。对于保密协议，如果其中没有包含竞业限制条款，或者劳动者没有违反竞业限制约定，那么劳动者就不需要支付违约金。
违反保密协议的责任：
- 虽然违反保密协议不需要支付违约金，但劳动者如果违反了保密义务，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。这种赔偿责任是基于劳动者对用人单位的商业秘密造成了实际损失，而不是基于违约金的约定。
实际案例：
- 在实际案例中，如王小明与公司签订的“保守商业秘密协议书”中约定了违约金，但法院认为，除劳动者违反服务期约定或违反竞业限制约定的外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。因此，王小明虽然违反了保密协议，但并不需要支付违约金，而是需要承担可能由此给用人单位造成的经济损失的赔偿责任。
综上所述，违反保密协议并不一定需要支付违约金，但劳动者需要承担可能由此给用人单位造成的经济损失的赔偿责任。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。