电瓶车喷漆改色是否违法，主要取决于电瓶车的类型以及是否按照规定办理相关手续。
对于电动自行车（非机动车）：
- 目前，法律法规并未对电动自行车更改车身颜色作出明确的禁止性规定。因此，单纯改变电动自行车的颜色，通常不会被认定为违法行为。
- 但需要注意的是，改装后的电动自行车必须符合国家标准，且不得影响车辆的安全性能。此外，部分城市在电动自行车上牌时会拍照留档，改色后可能与档案照片不符，可能带来实际操作上的麻烦。
对于电动轻便摩托车和电动摩托车（机动车）：
- 依据《中华人民共和国道路交通安全法》和《机动车登记规定》，已注册登记的机动车改变车身颜色的，机动车所有人应当在变更后十日内向登记地车辆管理所申请变更登记。这是法律规定的明确义务。
- 如果未在规定时间内办理变更登记，公安机关交通管理部门会责令其限期改正，并处警告或者二百元以下罚款。这意味着，未经备案擅自改变电动车颜色是违法的，上路后将面临处罚。
特殊提示：
- 无论电动车属于非机动车还是机动车范畴，在改变电动车颜色时，都不得改成警车、消防车、救护车、工程救险车等特殊车辆的配色或相似配色，也不得存在其他影响车身辨识度的情形。
综合建议：
- 在决定对电瓶车进行喷漆改色之前，建议先了解当地的相关法规和规定，确保自己的行为合法合规。
- 对于机动车而言，更是必须严格遵守变更登记的要求，确保改装行为的合法性。
- 如果有任何疑问或不确定的地方，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供准确的法律意见和指导。