企业有司法诉讼情况下，行政机关仍然可以进行行政处罚。下面我将从法律角度详细解释这一结论：
法律解释
独立性原则：
- 司法诉讼与行政处罚是两种独立的法律程序，分别由不同的法律机关（法院和行政机关）进行。
- 司法诉讼的存在并不妨碍行政机关依法对违法行为进行查处和处罚。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规，行政机关对违反行政法律法规的单位或个人有权依法进行处罚。
- 司法诉讼的进展或结果并不影响行政机关依据事实和法律进行行政处罚的权力。
不冲突原则：
- 行政处罚与司法诉讼在目的和程序上各有侧重，互不冲突。
- 行政处罚旨在纠正违法行为，维护社会秩序；而司法诉讼则旨在解决法律争议，保护当事人合法权益。
实例说明
假设一家企业因环境污染问题被环保部门立案调查，并可能面临行政处罚。同时，该企业也因合同纠纷被另一家企业提起民事诉讼。在这种情况下：
- 环保部门可以依据《环境保护法》等相关法律法规，对企业的环境污染行为进行查处，并依法作出行政处罚决定。
- 企业的民事诉讼并不影响环保部门对其环境违法行为的处罚程序。即使企业在民事诉讼中胜诉，也不能免除其因环境违法行为而应承担的行政责任。
法律建议
- 积极应对：企业在面临司法诉讼和行政处罚时，应分别积极应对，确保自身合法权益不受侵害。
- 法律咨询：如有需要，企业可以寻求专业律师的帮助，对司法诉讼和行政处罚进行法律咨询和应对策略的制定。
综上所述，企业有司法诉讼情况下，行政机关仍然可以进行行政处罚。两者在法律上是独立的程序，互不干扰。企业应分别应对，确保自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。