水田用来建房、菜地用作宅基地来规划农田，这两种行为在多数情况下均不合法。接下来，我将从两个方面进行详细分析：
一. 水田用来建房不合法
法律依据：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第六十二条的规定，农村村民建住宅应当符合乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。水田通常被视为农用地，特别是如果其被划定为永久基本农田，那么在这片土地上建房就违反了上述规定。
审批流程：
- 即使水田不是永久基本农田，农村居民在建造住宅时也需要经过乡镇政府的审核以及县级政府的批准。如果未经批准就在水田上建房，那么这样的建筑也属于违建。
法律后果：
- 根据《中华人民共和国行政强制法》的相关规定，行政机关有权对违法建筑予以公告，限期当事人自行拆除。当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不拆除的，行政机关可以依法强制拆除。
二. 菜地用作宅基地来规划农田不合法
土地用途变更的合法性：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》和相关法规，土地使用者可以改变国有土地用途，但必须依法依规办理有关审批手续，不得擅自改变用途或者不按照批准用途使用土地。菜地作为农用地，其用途变更为农田（特别是基本农田）同样需要经过严格的审批流程。
基本农田的保护：
- 基本农田是指中国按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划而划定的，不得占用的耕地。国家通过实施基本农田保护制度，对基本农田转为建设用地的行为进行严格控制。因此，将菜地用作宅基地来规划农田，很可能涉及到基本农田的非法占用和破坏。
法律救济途径：
- 如果认为宅基地被擅自划为基本农田不合法，有权向上级国土资源部门提出行政复议申请或直接向人民法院提起行政诉讼。在申请复议或诉讼过程中，务必提供充足的证据如宅基地的审批文件、土地权属证明等。
我的观点是，无论是水田用来建房还是菜地用作宅基地来规划农田，这两种行为在多数情况下均不合法。它们涉及到土地用途的擅自变更和基本农田的保护问题，可能面临法律制裁。因此，在进行任何土地用途变更之前，务必了解并遵守相关的法律法规和审批流程。如有进一步需要，您可以继续咨询我。