在非法收购、销售药品的案件中，所涉及的“金额5万元以上”这一表述，通常指的是药品的交易价格，也即收购或销售时的价格，而非药品的真实价格或成本价。这是因为，在法律实践中，非法交易行为的定罪量刑往往依据的是交易行为所涉及的具体金额，这一金额直接反映了违法行为的规模和严重程度。
分析说明：
法律条文依据：根据相关法律规定，如《刑法》中关于非法经营罪等罪名的规定，通常是以交易金额作为定罪量刑的依据。这些法律条文并未特别指明是药品的真实价格还是交易价格，但从法律实践来看，交易金额是判断违法行为严重程度的主要标准。
法律实践做法：在司法实践中，司法机关在查处非法收购、销售药品等违法行为时，会依据交易双方的实际交易金额来认定犯罪数额。这是因为交易金额直接反映了违法行为的规模和获利情况，是判断社会危害性和行为人主观恶性的重要依据。
逻辑推断：从逻辑上讲，如果以药品的真实价格或成本价作为定罪量刑的依据，那么行为人可能会通过虚报价格或成本来规避法律制裁，这显然不利于打击违法行为和维护市场秩序。因此，以交易价格作为判断标准更为合理和公正。
综上所述，非法收购、销售药品所涉及的“金额5万元以上”指的是药品的交易价格。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要更详细的法律解释，可以直接向我咨询。