民办学校借款是合法的。具体分析如下：
法律依据：
- 根据《民办教育促进法》第四十九条规定：“国家鼓励金融机构运用信贷手段，支持民办教育事业的发展。”这表明，从法律层面，民办学校是有权申请贷款的。
- 《贷款通则》第二条第二款也明确：“本通则所称借款人，系指从经营贷款业务的中资金融机构取得贷款的法人、其他经济组织、个体工商户和自然人。”民办学校作为法人，具有民事权利能力和民事行为能力，因此可以向金融机构申请贷款。
借款主体资格：
- 民办学校分为营利性和非营利性。无论是营利性还是非营利性民办学校，作为法人，它们都具有借款的主体资格。
- 相关司法实践也确认了金融机构与非营利性民办学校之间签订的借款合同合法有效，非营利性民办学校负有偿还贷款本息的义务。
借款注意事项：
- 金融机构在向民办学校发放贷款时，应区分其性质属于营利性还是非营利性，并严格把控担保方式，以确保自身合法权益。
- 对于非营利性民办学校，由于其具有公益性，其办学结余仅能用于自身办学用途，因此金融机构需要特别关注其还款来源和担保方式。
综上所述，民办学校借款是合法的，但具体借款条件和担保方式需根据学校的性质和金融机构的规定来确定。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的咨询，请随时向我提问。