小车停在摩托车停车位是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规依据
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第五十六条，机动车应当在规定地点停放。摩托车停车位是专为摩托车设计的，其尺寸、承载能力等均适配摩托车。小车停入此类停车位，显然不符合“在规定地点停放机动车”的要求。因此，在大多数情况下，此行为会被视为违法。
部分城市或地区可能还依据《道路交通安全法》制定了更为具体的实施办法，对违法停车行为（包括小车停放在摩托车停车位）设定了明确的罚款标准，如20元以上200元以下不等。
二、实际管理与处罚
交警管理：在城市道路旁、停车场等交警负责管理的区域，小车停放在摩托车停车位上，一旦被发现，交警有权按照违法停车进行处理，包括但不限于罚款、拖车等措施。
停车场管理：商场、小区等场所的停车场也有相应的管理规定。小车违规停放在摩托车停车位，管理方可能会要求车主立即移车，若不配合，可能会面临禁止再次进入停车场、锁车等后果。
三、特殊情况考虑
虽然大多数情况下小车停在摩托车停车位是违法的，但在某些地区，可能并未明确通过法规规定小车不能停放在摩托车停车位。在这种情况下，虽然行为本身不构成违法，但考虑到停车资源的合理分配、交通安全以及避免纠纷，仍然不建议小车占用摩托车停车位。
四、建议与指导
为避免法律风险和纠纷，驾驶员应严格遵守当地的交通法规和停车管理规定，选择合适的停车位进行停放。在不确定某个停车位是否可以停放小车时，建议咨询相关的管理人员或机构，以获取准确的信息和指导。
综上所述，小车停在摩托车停车位是违法的，且可能会面临相应的法律后果。因此，建议驾驶员在停车时务必遵守相关规定，选择合适的停车位进行停放。