员工自己申请工伤认定后，接下来的流程可以按照以下步骤进行：

一、提交工伤认定申请

员工需要在事故伤害发生之日起1年内（如用人单位未在规定时限内提出申请），向统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。申请时需填写《工伤认定申请表》，并提交以下材料：

1. 劳动、聘用合同文本复印件或者与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的其他证明材料；
2. 医疗机构出具的受伤后诊断证明书或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。

二、等待受理和审核

1. 受理：社会保险行政部门在收到工伤认定申请后，会在15日内对申请人提交的材料进行审核。如果材料完整，将作出受理决定，并出具《工伤认定申请受理决定书》；如果材料不完整，将一次性告知申请人需要补正的全部材料。
2. 审核与调查：在受理工伤认定申请后，社会保险行政部门可以根据需要对申请人提供的证据进行调查核实。这包括进入有关单位和事故现场、查阅与工伤认定有关的资料、询问有关人员并作出调查笔录等。

三、等待工伤认定决定

1. 决定时限：社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定决定。对于事实清楚、权利义务明确的工伤认定申请，可能会在15日内作出决定。
2. 决定书内容：如果认定为工伤，将出具《认定工伤决定书》，载明用人单位全称、职工基本信息、受伤害部位、事故时间和诊断时间等详细信息。如果不予认定为工伤，将出具《不予认定工伤决定书》，并说明不予认定的依据。

四、后续步骤

1. 送达决定书：社会保险行政部门会在工伤认定决定作出之日起20日内，将《认定工伤决定书》或《不予认定工伤决定书》送达受伤害职工（或其近亲属）和用人单位，并抄送社会保险经办机构。
2. 申请行政复议或提起行政诉讼：如果职工或其近亲属、用人单位对工伤认定决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
3. 劳动能力鉴定：如果职工被认定为工伤且存在残疾或影响劳动能力，可以在伤情相对稳定后向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请。申请时需填写劳动能力鉴定申请表，并提交有效的诊断证明、完整病历材料等。

以上就是员工自己申请工伤认定后的完整流程。在整个过程中，员工需要保持与社会保险行政部门的沟通，及时提供所需材料，并关注工伤认定决定的进展。